解码人类蛋白质组与强大的质谱仪

首先,一些背景

科学家估计,我们的细胞包含超过一百万结构独特的蛋白质,统称为人类蛋白质组。叫proteoforms,这些蛋白质有可能影响健康和疾病,因此科学家们非常感兴趣的学习他们的长相和能够识别它们。然而,商业质谱仪(MS)在本研究限制因素:需要数以百计的实验描述只有一小部分人类蛋白质组。和商业女士只能描述蛋白质约30道尔顿(或kDa,分子质量单位),它只占一半的人类蛋白质组。

科学家发现了什么?

使用一个强大的、敏感的仪器设计和建造MagLab,科学家发现了更多proteoforms人类大肠癌细胞每实验(使用了一种叫做液相色谱质谱/质谱)比先前的研究。

具体来说,最大最完整的蛋白质识别研究在此之前的工作集中在蛋白质分子质量的不到30 kDa,并要求423个独立的实验。MagLab相比之下,科学家发现了一个同样数量的蛋白质(1820)在八个实验——在不到2%的年长组实验所需的时间。这设定了新的效率标准完整蛋白质的分析。此外,MagLab实验确定蛋白质的大小介于5到55 kDa,延伸完整蛋白质的质量范围分析的两倍。

为什么这个很重要?

提高吞吐量、序列覆盖率和分子量范围的完整蛋白质分析将促进新发现成千上万的proteoforms,其中许多人类疾病有直接的临床意义。

研究了谁?

安德森开出信用证¹德哈特,C.J.^1、2,N.K.凯撒¹R.T.,小伙子们²史密斯测向,¹,j·b·格里尔²爱死你,进食²,G.T. Blakney¹下午,托马斯²凯莱赫,N.L.^2、3C.L. Hendrickson,^1、4

¹爱游戏提现客服国家高磁场实验室;²蛋白质组学卓越中心,西北大学;³西北大学化学系和分子生物科学;⁴化学和生物化学,佛罗里达州立大学

为什么他们需要MagLab ?

成功从复杂的生物样本中完整蛋白质的高通量鉴定需要仪器能够高质量分辨能力,质量精度、灵敏度、光谱采集率。MagLab的21-tesla傅里叶Transform-Ion回旋共振质谱仪(FT-ICR)最先进的在每一个这些至关重要的规范。仪器还允许科学家们获得更多的信息从少量的样本,这是重要的材料是有限的和/或昂贵。

细节为科学家

• 查看或下载的专家级科学强调,人类蛋白质21 T FT-ICR质谱鉴定
• 阅读完整的出版物,识别和描述的人类Proteoforms自上而下LC-21特斯拉FT-ICR质谱分析,在蛋白质组研究期刊》的研究

资金

这项研究是由下列补助:9 Boebinger (NSF dmr - 1157490);N.K.凯莱赫(NIH P41GM108569)

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有关更多信息,联系克里斯Hendrickson。