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打击COVID:挖掘更深的COVID-Causing蛋白质

Elan Eisenmesser
Elan Eisenmesser

斯蒂芬·Bilenky卡罗琳McNiel插图,照片

研究挖掘低于另一层的冠状病毒的膜的蛋白质的藏污纳垢之所。

现在公共卫生的脸部敌人# 1——COVID-19病毒——是品牌为我们的大脑:灰色orb钉一个阴森恐怖的森林所覆盖。

但据Elan Eisenmesser,科罗拉多大学医学院副教授,潜在的可怕的蛋白质是谎言海底urchin-like SARS-CoV-2的外观。这就是环绕着病毒的核衣壳蛋白的遗传物质,或RNA。

Eisenmesser说,这种结构可能致命的双重目的:和障碍,像一个邪恶的海盗的钩,身体的蛋白质它已经入侵并利用他们自己的目的:感染。

SARS-CoV-2病毒。

SARS-CoV-2病毒。

图片来源:卡罗琳McNiel

几个月,Eisenmesser一直在使用强大的核磁共振国家高磁场(NMR)仪器实验室在塔拉哈西,爱游戏体爱游戏提现客服育是什么佛罗里达州。调查这个想法。他比较这些蛋白质的行为SARS-CoV-1,负责2002 - 2003年的病毒疫情。两个堂兄弟彼此相似;事实上,他们的核衣壳蛋白91%相同。

Eisenmesser,在生物化学和分子遗传学,研究了SARS-CoV-1核衣壳超过十年前。所以当大流行爆发今年早些时候,他很快争取对抗这相关的微观的敌人。他说,他的发现可以解释可能的治疗方法,研究方向和药物靶点。

有强烈的理由怀疑,核衣壳做的不仅仅是保护病毒RNA在其前面盔甲,Eisenmesser说。这不是不寻常的“月光”——蛋白质或承担生物一边演出在他们的主要功能。这似乎对核衣壳蛋白,尤其可能远远超过峰值蛋白质在SARS病毒的家庭。

邪恶的次要目的的另一个线索是,一些地区似乎能够对结构内摆动。运动可以让他们爬在一个毫无戒心的宿主蛋白的结合位点。

“如果你仔细想想,它是有道理的,因为有这么多的核衣壳周围所有的RNA,“Eisenmesser说。“一些核衣壳可以绑定一个宿主蛋白,一些可能绑定另一个。它也可以特异性,这是我们与我们的同事感兴趣的看着这里,包括质谱专家。”Part of the nucleocapsid might target eye cells, for example, while another might latch onto lung cells.

Eisenmesser表明,这种行为的目的之一可能是禁用的免疫细胞,细胞因子和其他身体抵抗病毒分派的捍卫者。

“可能标记和停止参与正常的先天免疫反应的一种蛋白质——基本上只是阻止它作为,“他解释说。

MagLab的轨迹的仪器允许Eisenmesser拼凑,在原子层面,宿主病毒相互作用的细节。像其他科学家使用MagLab的设施在大流行期间,远程Eisenmesser正在进行他的实验;实验室工作人员,在这种情况下,技术/研究设计师阿什利蓝色,协助通过运行仪器现场根据他的指示。

生物物理学家Elan Eisenmesser一直在研究导致COVID-19的病毒的核衣壳。的结构是由419残留,包括两个独立折叠域,一个显示在蓝色(小n端结构域)和绿色(二聚作用域),每个对应一个不同的残留部分。是知之甚少的运动和功能区域的结构,用白色表示。

生物物理学家Elan Eisenmesser一直在研究导致COVID-19的病毒的核衣壳。的结构是由419残留,包括两个独立折叠域,一个显示在蓝色(小n端结构域)和绿色(二聚作用域),每个对应一个不同的残留部分。是知之甚少的运动和功能区域的结构,用白色表示。

图片来源:Elan Eisenmesser。

具体地说,核磁共振可以帮助Eisenmesser识别核衣壳区域动态、量化这些动力学和检查他们的时间表与各种宿主蛋白的相互作用。他观察到宿主蛋白质似乎目标核衣壳内的更有活力的地区。这是有力的证据,他说,灵活的部分核衣壳是动态,以便连接到主机的蛋白质。

“他们不一定在忙活着毫无理由,”他说。

“这就是核磁共振是如此之大,”Eisenmesser补充说,“因为它可以用于屏幕提出主机交互,使用核衣壳的不同部分,从而确定哪一部分被用于目标主机”。

有条不紊地检查不同的场景可能会导致发现与宿主蛋白的交互已经熟悉制药公司。

“事情可能已经在管道或临床批准,“Eisenmesser说。“所以你可以识别潜在的阻止试剂已经存在阻止核衣壳针对特定蛋白质。”

由克里斯汀科因

打击COVID

本系列关注MagLab科学家们利用他们的专长和轨迹在对抗COVID-19磁铁。

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卫生研究

最后修改于2022年11月02